Die Verwaltung der Fondation Cancer ist einem Vorstand anvertraut, der aus maximal acht Mitgliedern besteht. Die Mitglieder des Verwaltungsrats bleiben für aufeinanderfolgende Amtsperioden von zwei Jahren im Amt und können wiedergewählt werden. Der Vorstand entscheidet über die allgemeine Politik der Fondation Cancer und wählt zwischen allen Mitgliedern einen Vorsitzenden und zwei Vize-Präsidenten. Die Mitglieder werden nicht entlohnt, da sie ehrenamtlich arbeiten.